[[Bestand:Tick male size comparison (aka).jpg|thumb|100x60px|left|Een teek is kleiner dan de kop van een lucifer]]
De E1 is een erg veilige wandelroute. Het grootste gevaar schuilt in een bijna onzichtbaar klein diertje: de [[Teken (dieren)|teek]]. Teken kunnen (in wisselende mate; in sommige streken is bijna 100% van de teken besmet) dragers zijn van gevaarlijkelevensgevaarlijke parasieten. In het hele gebied van de E1 komt de [[ziekte van Lyme]] voor, die door tekenbeten wordt verspreid. Tegen deze ziekte kan men zich niet vaccineren, maar men moet zich elke avond controleren op de aanwezigheid van teken. Is men eenmaal besmet, dan is een kuur met antibiotica noodzakelijk.
In [[Schotland]] en in de Franse [[Franse Alpen]] moet je opgewassen zijn tegen onbewoonde gebieden en bergtrajecten. Ervaring met bergwandelen is daar noodzakelijk, tenzij je onder leiding van een gids loopt. In Schotland zal het soms noodzakelijk zijn eten voor verscheidene dagen mee te nemen en eventueel een tent en slaapzak. Elders in de [[Schotse Hooglanden]] en overal in de Franse Alpen dien je je overnachtingen zorgvuldig te plannen en eventueel te reserveren. Bij plaatselijke waarschuwingen voor slecht weer moet je niet op stap gaan; vraag elke ochtend nadrukkelijk wat de weersverwachtingen zijn.
Andere gevaren langs de route zijn gering: [[Bruinebeer|bruine beren]], [[Wild zwijn|wildeWilde zwijnen]] en ander [[groot wild]] zijn in de regel schuw. [[Rabies]] (hondsdolheid) komt voor onder in het bos levende dieren, maar is zeldzaam.
Er zijn geen indicaties van hoge criminaliteit langs de E1.
